清杨守敬、熊会贞合著。四十卷。汇集明清以来研究《水经注》的诸方面成果，为郦学总结性著作。凡郦氏所征引故实，皆注明出典;于郦氏所叙水道，皆详其迁流，并于全祖望、赵一清、戴震诸家的校释，多有订正。初稿完成于光绪三十年(1904)。以篇幅庞大，刊行不易，曾先刊印《水经注疏要删》(1905)、《水经注疏要删补遗》和《续补》(1909);同时仍对原稿不断予以增补改订。1915年杨氏去世，曾以生前此书未能刊行为憾。后由熊会贞继续修订。直至1936年熊氏弃世，尚未最后定稿。1955年始由中国科学院向住在武昌的黄陂徐行可处购得熊氏请人过录的抄本，予以影印出版。因未经校定，故讹脱之处甚多。1971年台湾中华书局又将前中央研究院于1938年从杨守敬孙杨勉之处购得的另一部抄本(与徐氏所藏同一书手)影印出版。然后者因由熊氏在抄本上继续校阅修改，则较前者为优。但亦非熊氏最后定本。后由段熙仲氏以北京本为底本做了点校工作，继而陈桥驿氏又按台北本、参以钟凤年氏《水经注疏勘误》，结合个人研究对段氏点校本予以复校、增删、勘误，1989年由江苏古籍出版社排印出版，是目前《水经注疏》的最佳版本。